不能生吃菱、藕、荸荠的原因是它们含有一定的毒素，生吃会对人体造成伤害。具体原因如下：
菱：菱中含有草酸，生吃会刺激口腔和胃肠道，引起腹泻、呕吐等症状。同时，菱中还含有一种叫做氰甙的毒素，如果摄入过多，会引起中毒。
藕：藕中含有草酸和草酸钙，生吃会刺激口腔和胃肠道，引起腹泻、呕吐等症状。同时，藕中还含有一种叫做荷包牡丹碱的毒素，如果摄入过多，会引起中毒。
荸荠：荸荠中含有草酸和草酸钙，生吃会刺激口腔和胃肠道，引起腹泻、呕吐等症状。同时，荸荠中还含有一种叫做荸荠碱的毒素，如果摄入过多，会引起中毒。
因此，为了避免食品中毒，我们应该将这些食材煮熟或烤熟后再食用。